食物摄入、消化、吸收均由消化系统完成；如果消化系统的某一组成部分发生了疾病，即可引起厌食。常见疾病有下列数种：
(1)消化功能紊乱症：
此类症状很常见。由于小儿消化系统发育还不成熟，担负的任务又很重，受到内外不良刺激后，即可发生肠道运动功能及消化吸收功能紊乱。此类症状除厌食外，常伴有恶心、呕吐、腹痛、腹泻、便秘等。
(2)肠道寄生虫病：
如蛔虫病、蓝氏贾第鞭毛虫病、钩虫病和绦虫病。此类疾病除厌食症外，多伴有腹痛、消瘦等症状。驱虫治疗后，上述症状可消失。
(3)慢性胆道感染：
常缺乏典型症状，多以低热和厌食为主要表现，确诊靠十二指肠引流，取胆汁化验。
(4) 迁延性和慢性肝炎：
除有厌食外，常伴有肝脏肿大和肝功能检查异常。
(5)慢性胃炎和消化性溃疡：
近年发病有增多趋势，多数患儿症状不典型，但都有食欲不振，确诊靠钡餐透视和胃镜检查。
(6)原发性肠吸收不良综合征：
由于某些消化酶的缺乏，谷物、蛋白质或脂肪消化不良。此综合征除顽固性厌食外，常伴有慢性腹泻、体重减轻，且多有家族史。
(7)牛乳过敏症：
患儿对牛乳中的蛋白质过敏，除厌食症外，均伴有腹泻。改用其他代乳品即可痊愈。
(8)习惯性便秘：
一般均有厌食表现。
(9)牙齿疾病：
严重的牙齿疾病，常影响进食，时间长了，会诱发厌食。
