心胸外科是淮海经济区唯一专业收治小儿先天性心脏病的专业队伍。自1998年成立以来，收治各种先天性心脏病千余例，手术量每年递增30%以上，现每年手术量达200例左右，小儿先心手术量名列全市前茅。已开展的手术有动脉导管未闭结扎、空间隔缺损、房间隔缺损修补术、法洛四联症一期根治术、完全性心内膜垫缺损纠治术、肺静脉异位引流纠治术、三尖瓣下移纠治术、室隔完整形肺动瓣闭锁纠治术、大动脉转位装换术、主动脉缩窄一期根治术等等，手术成功率达国内水来。率先在我市及淮海经济区开展了婴幼儿先天性心脏病的手术治疗，内心直视手术最小年龄6天，最低体重2.8公斤；法洛四联症根治术最小年龄2个月。近二年来，我们连续手术治疗婴儿（一岁以内）室间隔缺损200余例，成功率98%。同时我们积极开展急、危重先天性心脏病急诊、亚急诊手术50余例，8例小婴巨大室间隔缺损、房间隔缺损、肺动脉高压并发心、肺功能不全，在不能脱离呼吸机情况下，给予急诊心脏手术，均获得成功。婴幼儿先天性心脏病的手术治疗在淮海经济区一直处于领先水平。我们不断引进开展新技术、新业务，在上海儿童医学中心建立了协作关系。
我院心胸外科人才结构及梯队合理、规范，流程清晰，职责明确，其中人员包括心胸外、术后监护、麻醉、体外循环手术、心内、心脏超声检查、放射、心电图，以上人员均经上海新华医院（现上海儿童医疗中心）心胸外科进修学习。我们心脏外科拥有进口心脏彩超机、X光机、麻醉机、体外循环机、多台进口呼吸机、心脏监护仪、几十台微量输液泵等专用设备。
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