用基因组分析技术找到肝癌转移关键突变基因

  全程导医网 健康焦点:上海交通大学医学院附属瑞金医院和国家人类基因组南方研究中心肿瘤基因组课题组韩泽广教授、邓庆博士与黄健研究员领衔的科研团队,最近首次利用新型大规模基因组分析技术,找到肝癌转移关键突变基因。相关研究论文于8月26日在线发表在国际顶尖学术刊物《自然·遗传学》杂志上。专家认为,该研究结果将为肝癌诊断、预后、治疗以及开发新型治疗药物奠定基础。

  韩泽广等科研人员与上海生物芯片国家工程研究中心、复旦大学附属中山医院、无锡市人民医院等单位合作,利用DNA测序技术,对乙肝病毒感染相关的肝癌原发灶和侵犯肝脏门静脉转移灶的全部基因组外显子进行比对分析,发现肿瘤细胞存在347个突变基因,平均每个肿瘤样本有30个~40个基因突变,其中大多数基因突变是第一次在肝癌样本中发现,并且在原发灶和转移灶中同时出现,说明肝癌发病、转移与基因突变密切相关,而转移相关基因在原发肿瘤中即发生突变,而不是在肿瘤转移过程中发生。另外,从碱基突变规律发现,突变除受黄曲霉素和内源代谢产物影响外,也可能与植物特定成分(如马兜铃酸)和塑料工业污染物有关。

  为了确定哪个突变基因在肝癌转移中发挥关键作用,科研人员进一步在大量肝癌样本中,对这些突变基因进行评估以及大规模的功能实验分析研究。结果表明,大多数基因突变不是关键的,仅少数基因突变决定了肿瘤发病和转移,其中ARID1A、VCAM1和CDK14等基因突变发挥关键作用。ARID1A和VCAM1基因在功能正常时,起抑制肿瘤细胞作用,当突变发生导致基因功能丧失或者表达降低时,肿瘤细胞会出现增殖加快、运动和侵袭能力增强。目前,科研人员已经发现,13%的肝癌患者发生ARID1A基因突变;VCAM1除了突变外,还在多数肝癌样本中表达下降。而与细胞增殖相关的CDK14基因突变则会增强该基因功能,导致细胞生长加快,促进转移,可能是肝癌治疗新靶标。